庆良间诸岛国立公园有造礁珊瑚、绿蠵龟、日本地龟和座头鲸等生物，欢迎您来此观赏。
庆良间群岛珊瑚礁拥有 248 种造礁珊瑚，已于 2005 年入选《拉姆萨尔湿地名录》。6 月左右是珊瑚的产卵季，一些存活下来的珊瑚幼虫会被海浪带到冲绳本岛西岸，并栖居于此地的海域中。
庆良间群岛拥有 620 多种土生土长的植物。岛上的森林中则有 46 种不同的树木，林中的蒲葵和琉球松生长得十分繁盛。当地地貌深受季风影响，因此树木相对矮小。
庆良间群岛上栖息着许多独特罕见的野生动物，包括剑尾蝾螈、日本地龟、绿蠵龟、琉球歌鸲和庆良间鹿，庆良间群岛的外海区域则是座头鲸的繁殖地。
